国家安全理事会发出学校複课的标准作业程序（SOP），目前僅限大馬教育文憑（SPM），大馬技職證書（SVM），大馬高級學校文憑（STPM），以及大馬高級宗教文憑（STAM）以及同等國際水平考試的學生復課，但是日期仍未確定。其他階段的學生則居家學習，直至收到教育部的通知。
復課SOP的重點整理如下：
- 所有教职员和学校访客都必须下载“MySejahtera”手机应用程式，以作为日后追踪密切接触者的用途。
- 一旦体温超过摄氏37.5度，及出现如喉咙痛、咳嗽、呼吸困难等症状的学生、所有教职员及合约工人，都不被允许进入学校范围。
- 所有运动项目、面对面的课外活动、学校集会或涉及师生的群聚活动都不能进行。
- 只有上午班的学校，开放时间为上午7时至下午4时；而拥有两个时段即上、下午班的学校，开放时间为上午7时至傍晚6时45分。
- 每間學校必須設有隔離室，一旦學生出現症狀需立即帶往隔離室，並聯係臨近的衛生中心。
- 校方必须在校门口或集合地点为教师、学生和学校成员包括合约工人测量体温，且必须在每日上课前为学生和教职员进行健康检查。
- 校方也必须确保学生在校内所进行的一切活动，都必须保持1公尺的社交距离；学生的桌子也必须维持1公尺的距离。
- 一旦校内有人被县卫生局确认感染新冠肺炎，那么有关学校就必须进行消毒。
